No se puede instalar el paquete python de netCDF4 en OS X

Estoy intentando instalar netCDF4 en OS X con pip install netCDF4 y recibo el siguiente error:

 ------------------------------------------------------------ /usr/local/bin/pip run on Wed Aug 7 23:02:37 2013 Downloading/unpacking netCDF4 Running setup.py egg_info for package netCDF4 HDF5_DIR environment variable not set, checking some standard locations .. checking /Users/mc ... checking /usr/local ... checking /sw ... checking /opt ... checking /opt/local ... checking /usr ... Traceback (most recent call last): File "", line 16, in  File "/var/folders/jj/0w0dd3n16jq4g5579g6c7h040000gn/T/pip-build/netCDF4/setup.py", line 114, in  raise ValueError('did not find HDF5 headers') ValueError: did not find HDF5 headers Complete output from command python setup.py egg_info: HDF5_DIR environment variable not set, checking some standard locations .. checking /Users/mc ... checking /usr/local ... checking /sw ... checking /opt ... checking /opt/local ... checking /usr ... Traceback (most recent call last): File "", line 16, in  File "/var/folders/jj/0w0dd3n16jq4g5579g6c7h040000gn/T/pip-build/netCDF4/setup.py", line 114, in  raise ValueError('did not find HDF5 headers') ValueError: did not find HDF5 headers ---------------------------------------- Command python setup.py egg_info failed with error code 1 in /var/folders/jj/0w0dd3n16jq4g5579g6c7h040000gn/T/pip-build/netCDF4 Exception information: Traceback (most recent call last): File "/usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/pip-1.2.1-py2.7.egg/pip/basecommand.py", line 107, in main status = self.run(options, args) File "/usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/pip-1.2.1-py2.7.egg/pip/commands/install.py", line 256, in run requirement_set.prepare_files(finder, force_root_egg_info=self.bundle, bundle=self.bundle) File "/usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/pip-1.2.1-py2.7.egg/pip/req.py", line 1042, in prepare_files req_to_install.run_egg_info() File "/usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/pip-1.2.1-py2.7.egg/pip/req.py", line 236, in run_egg_info command_desc='python setup.py egg_info') File "/usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/pip-1.2.1-py2.7.egg/pip/util.py", line 612, in call_subprocess % (command_desc, proc.returncode, cwd)) InstallationError: Command python setup.py egg_info failed with error code 1 in /var/folders/jj/0w0dd3n16jq4g5579g6c7h040000gn/T/pip-build/netCDF4 

Ya instalé HDF5 en /usr/local/hdf5/ pero sigo recibiendo el mismo error. Soy nuevo en Python, así que cualquier ayuda será muy apreciada.

Gracias.

Es posible que deba establecer la variable de entorno HDF5_DIR en la ubicación donde instale HDF5; está buscando en las rutas de instalación estándar y no encuentra los encabezados para HDF5, por lo tanto, al menos uno de sus errores.

Simplemente puede configurarlo antes de llamar a pip:

 HDF5_DIR=/usr/local/hdf5 pip install netCDF4 

o exportarlo y luego llamar a pip:

 export HDF5_DIR=/usr/local/hdf5 pip install netCDF4 

Simplemente intente este procedimiento para instalar netCDF4

  1. instala HDF5 desde el enlace

  2. instala netcdf4 desde el enlace

  3. instala netcdf4-python desde el enlace

Para más detalles visite el enlace.