Desarrollo de Python
  1. Desarrollo de Python
  3. usando stdint con swig y numpy.i
Intereting Posts
Eliminando BOM de gzip’ed CSV en Python Realice una llamada de función en una lista de comprensión solo una vez si es necesario dos veces Paramiko se cuelga durante la autenticación, cuando se ejecuta a fuerza de unittest runner Django Forms: Clave foránea en un campo oculto flask: ¿cómo diseñar el proyecto con múltiples aplicaciones? PyInstaller: el ejecutable de un solo archivo no se ejecuta Cambio de iframes con Python / Selenium django.db.migrations.exceptions.InconsistentMigrationHistory Excluyendo los resultados no deseados de findAll utilizando BeautifulSoup añadiendo matrices de diferentes formas ¿Cómo crear una matriz numpy desde un AudioSegment pydub? Virtualenv con Eclipse (Galileo) El call_command de Django falla con la falta de argumentos requeridos Combina listas uniendo cadenas con valores de índice coincidentes Usando un dict de Python para una sentencia SQL INSERT

usando stdint con swig y numpy.i

Estoy desarrollando un módulo para usar c inline en código Python basado en swig . Para eso me gustaría hacer arreglos numpy accesibles en C Hasta ahora utilicé tipos C como unsigned short pero me gustaría usar tipos como uint16_t de stdint.h para guardar cualquier comstackdor que encuentre mi módulo.

Desafortunadamente, las funciones de c++ no se ajustan correctamente cuando se usan tipos stdint.h . El error dado es: _setc() takes exactly 2 arguments (1 given) . Eso significa que la función no está numpy para aceptar matrices numpy . El error no se produce, cuando uso, por ejemplo, unsigned short .

¿Tiene alguna idea de cómo puedo hacer que los arreglos numpy map se numpy en stdint-types ?

interface.i NO funciona: 

 /* interface.i */ extern int __g(); %} %include "stdint.i" %include "numpy.i" %init %{ import_array(); %} %apply (uint16_t* INPLACE_ARRAY3, int DIM1) {(uint16_t* seq, int n1)}; extern int __g();

c++ función c++ NO funciona: 

 #include "Python.h" #include  #include  extern uint16_t* c; extern int Dc; extern int Nc[4]; void _setc(uint16_t *seq, int n1, int n2, int n3) { c = seq; Nc[0] = n1; Nc[1] = n2; Nc[2] = n3; }

interface.i trabajando: 

 /* interface.i */ extern int __g(); %} %include "stdint.i" %include "numpy.i" %init %{ import_array(); %} %apply (unsigned short* INPLACE_ARRAY3, int DIM1) {(unsigned short* seq, int n1)}; extern int __g();

Función c++ funcionando: 

 #include "Python.h" #include  #include  extern unsigned short* c; extern int Dc; extern int Nc[4]; void _setc(unsigned short *seq, int n1, int n2, int n3) { c = seq; Nc[0] = n1; Nc[1] = n2; Nc[2] = n3; }

Jaja, encontré una “solución” solo unos minutos después de que me rendí y publiqué esta pregunta.

Edité el numpy.i para ajustarlo a mi causa: sustituí los tipos C antiguos con los tipos stdint.h en las líneas 3044 ff: 

 [..] /* Concrete instances of the %numpy_typemaps() macro: Each invocation * below applies all of the typemaps above to the specified data type. */ %numpy_typemaps(int8_t , NPY_BYTE , int) %numpy_typemaps(uint8_t , NPY_UBYTE , int) %numpy_typemaps(int16_t , NPY_SHORT , int) %numpy_typemaps(uint16_t , NPY_USHORT , int) %numpy_typemaps(int32_t , NPY_INT , int) %numpy_typemaps(uint32_t , NPY_UINT , int) %numpy_typemaps(long , NPY_LONG , int) %numpy_typemaps(unsigned long , NPY_ULONG , int) %numpy_typemaps(int64_t , NPY_LONGLONG , int) %numpy_typemaps(uint64_t, NPY_ULONGLONG, int) %numpy_typemaps(float , NPY_FLOAT , int) %numpy_typemaps(double , NPY_DOUBLE , int) [..]

Me pregunto si alguien tiene una idea mejor que editar el numpy.i

Saludos Jochen