Las pandas no pueden leer el archivo hdf5 creado con h5py

Recibo un error de pandas cuando bash leer archivos de formato HDF5 que he creado con h5py. Me pregunto si estoy haciendo algo mal.

import h5py import numpy as np import pandas as pd h5_file = h5py.File('test.h5', 'w') h5_file.create_dataset('zeros', data=np.zeros(shape=(3, 5)), dtype='f') h5_file.close() pd_file = pd.read_hdf('test.h5', 'zeros') 

da un error: TypeError: no puede crear un almacenador si el objeto no existe o si se pasa un valor

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Intenté especificar el conjunto de claves en ‘/ ceros’ (como lo haría con h5py al leer el archivo) sin suerte.

Si uso pandas.HDFStore para leerlo, me devuelvo una tienda vacía:

 store = pd.HDFStore('test.h5') >>> store  File path: test.h5 Empty 

No tengo problemas para leer el archivo recién creado con h5py:

• Aplicar la función en los valores acumulativos de las series pandas.
• Subtotales para el índice y la columna de la tabla dinámica de Pandas
• Filtrar columnas de solo ceros de un dataframe de Pandas
• ¿Pandas de valores de columna a columnas?
• Creación de un reemplazo parcial de SAS PROC SUMMARY en Python / Pandas

 h5_back = h5py.File('test.h5', 'r') h5_back['/zeros'] <HDF5 dataset "zeros": shape (3, 5), type " 

Usando estas versiones:

 Python 3.4.3 (v3.4.3:9b73f1c3e601, Feb 23 2015, 02:52:03) [GCC 4.2.1 (Apple Inc. build 5666) (dot 3)] on darwin pd.__version__ '0.16.2' h5py.__version__ '2.5.0' 

Muchas gracias de antemano, Masha

 import pandas as pd import numpy as np pd.Series(np.zeros((3,5),dtype=np.float32).to_hdf('test.h5','test')