Estoy tratando de hacer una gráfica 3D que consiste en una serie de planos 2D a través de una stack RGB, como esta: Sé que es posible hacerlo usando mpl_toolkits.mplot3d pasando las coordenadas x, y, z y los colores RGB (A) de cada píxel a plot_surface : import numpy as np from matplotlib import pyplot […]
Me gustaría visualizar un archivo de datos VTK (salida de OpenFOAM) usando python. El gráfico que me gustaría hacer es un gráfico de línea 1-d de una cantidad entre dos puntos finales. Para hacerlo, los datos no estructurados deben interpolarse en los puntos que se encuentran entre los dos puntos finales. He usado el paquete […]
Estoy usando la biblioteca Python de MayaVi para trazar puntos 3d, usando la clase points3d . La documentación especifica que el color de cada punto se especifica a través de un cuarto argumento, s : Además, puede pasar una cuarta matriz s de la misma forma que x, y, yz, dando un valor escalar asociado […]
Quiero usar Mayavi. Situación Yo uso un MacBook Air, con OSX 10.7.3. Yo uso Python 2.7.2 Tengo virtualenv instalado. Pero no lo he usado para esta instalación. He instalado manualmente todas sus dependencias, incluyendo VTK . Para VTK , seguí su guía de instalación e instalé la envoltura de python. Ahora, si abro una nueva […]
Tengo un gran conjunto de datos de (x, y, z) posiciones de proteínas y me gustaría trazar áreas de alta ocupación como mapa de calor. Lo ideal es que la salida se vea similar a la visualización volumétrica a continuación, pero no estoy seguro de cómo lograrlo con matplotlib. Mi idea inicial fue mostrar mis […]
Actualicé mi MacBook a Mavericks, reinstalé Macports y todos los módulos de Python 2.7 que suelo usar. Mientras ejecuto Python recibo los siguientes mensajes: al importar mlab: from mayavi import lab (process:1146): Gtk-WARNING **: Locale not supported by C library. Using the fallback ‘C’ locale. cuando se ejecuta un comando mlab como mlab.mesh (), la […]
Quiero trazar 3d cuboid en python. Entrada: centro (3 puntos para el centro) radio (3 valores de radio, uno para cada dimensión) Idealmente, debería ser una ttwig de una estructura alámbrica (necesito ver qué hay dentro). No estoy exactamente seguro de cómo hacerlo. Usar python matplotlib o Mayavi está bien. ¡Gracias! Hasta ahora he probado […]
Estoy tratando de hacer un video de las trayectorias de las partículas. Sin embargo, de alguna manera mi escena nunca se actualiza. Aquí hay un ejemplo muy simple: from __future__ import absolute_import, division, print_function from mayavi import mlab import numpy as np import math alpha = np.linspace(0, 2*math.pi, 100) xs = np.cos(alpha) ys = np.sin(alpha) […]
Tengo 3 parámetros diferentes, X, Y y Z en un rango de valores, y para cada combinación de estos un cierto valor de V. Para que sea más claro, los datos se verían de esta forma. XYZV 1 1 2 10 1 2 3 15 etc… Me gustaría visualizar los datos con un trazado de […]
Estoy tratando de aprender mayavi2 para python y no puedo obtener mi savefig para mostrar mis gráficos. Encontré este código de ejemplo: from numpy import pi, sin, cos, mgrid dphi, dtheta = pi/250.0, pi/250.0 [phi,theta] = mgrid[0:pi+dphi*1.5:dphi,0:2*pi+dtheta*1.5:dtheta] m0 = 4; m1 = 3; m2 = 2; m3 = 3; m4 = 6; m5 = 2; […]