Articles of rpy2

¿Cómo establecer la variable de entorno R_HOME en el directorio de inicio de R?

Estoy intentando importar rpy2 en python y recibo este error: RuntimeError: The R home directory could not be determined. Try to install R , set the R_HOME environment variable to the R home directory, or add the directory of the R interpreter to the PATH environment variable. Estoy completamente perdido aquí, ya que no tengo […]

Instalación del módulo “rpy2” de python después de instalar Enthought Canopy

Algunos de mis scripts de python utilizan rpy2 como una interfaz para R, que funcionó perfectamente con el python de Enthought EPD anterior. Recientemente instalé Canopy Python desde Enthought. Python ya no encuentra el módulo rpy2, y cuando bash reinstalarlo, aparece el siguiente error: $ easy_install rpy2 […] Processing rpy2-2.3.5.tar.gz Writing /var/folders/9n/qk8wf11d205b0lrr57wyg7k80000gp/T/easy_install-HIclIh/rpy2-2.3.5/setup.cfg Running rpy2-2.3.5/setup.py -q […]

Error al cargar rpy2 con anaconda

Estoy tratando de cargar rpy2 dentro de un proyecto en el que estoy trabajando con anaconda y rpy2 un error sorprendente para el que no puedo encontrar una solución. Mi versión de python es 3.4 , mi versión de anaconda es 3.17.0 – Estoy usando una Mac (OSX Yosemite versión 10.10.4) R version 3.2.2 (2015-08-14) […]

Convertir un Listyvector RPy2 a un diccionario de Python

El equivalente natural de Python a una lista nombrada en R es un dict, pero RPy2 le da un objeto ListVector . import rpy2.robjects as robjects a = robjects.r(‘list(foo=”barbat”, fizz=123)’) En este punto, a es un objeto ListVector . [StrVector, FloatVector] foo: [str] fizz: [123.000000] Lo que me gustaría tener es algo que pueda tratar […]

alineando distintos gráficos no facetarios en ggplot2 usando Rpy2 en Python

Estoy combinando dos plots distintas en un diseño de grid con grid como lo sugiere @lgautier en rpy2 usando python. La gráfica superior es una densidad y la gráfica de barras inferior: iris = r(‘iris’) import pandas # define layout lt = grid.layout(2, 1) vp = grid.viewport(layout = lt) vp.push() # first plot vp_p = […]

Error de Rpy2 wac-a-mole: R_USER no definido

Estoy ejecutando Python (x, y) 2.7 en Windows 7 32 bit y R versión 3.1.0. He estado intentando instalar Rpy2 y he estado recibiendo muchos errores. Finalmente encontré este sitio que tiene módulos de Python precomstackdos para windows http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/ , así que descargué rpy2‑2.4.2.win32 ‑ py2.7.exe. Cuando hice esto e intenté import rpy2.robjects as robjects […]

¿El problema de Bizzarre al intentar que Rpy2 2.1.9 funcione con R 2.12.1, usando Python 2.6 en Windows XP? ¿Rpy no puede encontrar el R.dll?

He estado teniendo un problema real al intentar que Rpy2 funcione bien con mi instalación de R Primero intenté instalar el paquete MSI rpy2, y esto no pareció funcionar. Cuando ejecuté las pruebas recomendadas, me estaba dando un error que decía que no podía encontrar el R.dll, porque el nuevo R instala (post 2.11) instala […]

Rpy2 no encuentra el paquete

Estoy usando Rpy2 en Windows 7 64 y tengo problemas para cargar un paquete: en R: using(mi) en python: from rpy2.robjects.packages import importr mi=importr(‘mi’) ————————————————————————— RRuntimeError Traceback (most recent call last) in () —-> 1 mi=importr(‘mi’) C:\Anaconda\lib\site-packages\rpy2\robjects\packages.pyc in importr(name, lib_loc, robject_translations, signature_translation, suppress_messages, on_conflict, data) 397 if _package_has_namespace(rname, 398 _system_file(package = rname)): –> 399 env […]

Diferencia en los modelos de estadísticas de Python OLS y R’s lm

No estoy seguro de por qué estoy obteniendo resultados ligeramente diferentes para un OLS simple, dependiendo de si utilizo la interfaz rpy experimental de panda para realizar la regresión en R o si uso statsmodels en Python. import pandas from rpy2.robjects import r from functools import partial loadcsv = partial(pandas.DataFrame.from_csv, index_col=”seqn”, parse_dates=False) demoq = loadcsv(“csv/DEMO.csv”) […]

Cómo instalar rpy2 en Mac OS X

Estoy intentando, hasta ahora sin éxito, instalar el rpy2 para python en mi Mac OSX. He probado Macports y DarwinPorts pero no he tenido suerte con import rpy2 dentro del entorno de shell de python. No sé mucho acerca de la progtwigción en Mac y soy un experto en instalar módulos en un sistema basado […]